Home
Jobs
Institut Pasteur
Ingénieur bio-informatique - H/F

Ingénieur bio-informatique - H/F

On site

Paris, France

Freelance

06-05-2025

Share this job:

Expired

Job Specifications

L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.
Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur.
L'unité " Cellules dendritiques et immunité adaptative " étudie les bases cellulaires de l'immunité anti-tumorale. Nous visons à comprendre les interactions cellulaires entre cellules dendritiques et lymphocytes T dans le contexte du cancer et des immunothérapies.

Responsabilités :

Les objectifs du projet sont de :
Caractériser les infiltrats intratumoraux (cellules myéloïdes, cellules dendritiques et lymphocytes T) et de définir des typologies d'infiltrats associés à des prognostiques favorables ou défavorables ;
Comprendre comment les cellules dendritiques interagissent avec les lymphocytes T dans les tumeurs ;
Identifier de nouveaux mécanismes moléculaires d'interactions entre cellules dendritiques et lymphocytes T ;
Évaluer l'impact des immunothérapies sur les infiltrats immunitaires dans les tumeurs.
Missions principales :
Réaliser des analyses bioinformatique de façon autonome (single cell RNAseq, spatial transcriptomics) sur des data générées au laboratoire ou des datasets publics
Présenter les résultats en labmeetings
Collaborer efficacement avec des biologistes (PhD, postdocs)
Interagir de façon productive avec d'autre bioinformaticiens.
Profil

Nous recherchons des personnes hautement motivées pour produire une recherche innovante dans le domaine de l'immunologie du cancer et l'immunothérapie.
Vous avez idéalement :
Une formation bioinformatique ( M2/Msc level, grandes écoles).
Un intérêt prononcé pour l'analyse biologique en cellule unique.
Une capacité à coder dans R et travailler avec SEURAT
Une grande capacité à interagir avec divers types de profils professionnels (biologistes..).
Un intérêt pour la recherche sur le cancer.
Dynamisme, organisation et motivation.

Une expérience pratique avec :
R programming; SEURAT
SCENIC; CELLPHONEDB; NICHENET; CytoSPACE.
Transcriptomics data, single cell RNA sequencing datas, spatial transcriptomics, TCR sequencing
Serait grandement valorisée dans le processus de sélection.

Vos conditions et environnement de travail :

Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport
Cantine d'entreprise, restaurant, cafétérias
Mutuelle familiale (gratuité conjoints/enfants) et service de santé pour les collaborateurs sur le campus
Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives sur le campus
Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées
Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités sur le campus)

Ref : 23990992

About the Company

The Institut Pasteur, a non-profit foundation with recognized charitable status set up by Louis Pasteur in 1887, is today an internationally renowned center for biomedical research with a network of 33 members worldwide. In the pursuit of its mission to tackle diseases in France and throughout the world, the Institut Pasteur operates in four main areas: research, public health, training, and development of research applications. The Institut Pasteur is a globally recognized leader in infectious diseases, microbiology, and im... Know more