Job Specifications
À propos de nous
Le Collège de France est un grand établissement public d’enseignement supérieur et de recherche. Institution unique en France et sans équivalent à l’étranger, le Collège de France répond à une double vocation : être à la fois le lieu de la recherche la plus audacieuse et celui de son enseignement. Voué à la recherche fondamentale, le Collège de France possède cette caractéristique singulière : il réalise puis enseigne « le savoir en train de se constituer dans tous les domaines des lettres, des sciences ou des arts ». Situé sur différents sites de Paris (place Marcelin Berthelot, rue du Cardinal Lemoine, rue d’Ulm, Belle Gabrielle) l’établissement héberge un millier de personnes : enseignants-chercheurs, chercheurs, doctorants et post-doctorants, ingénieurs et techniciens, bibliothécaires, administratifs. Le Collège de France est membre associé de l'Université Paris Sciences et Lettres (PSL).
Environnement de travail
La Plate-forme Orion, située au sein du collège de France, regroupe les activités technologiques mutualisées du Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie (CIRB), unité INSERM 1050, UMR CNRS 7241.
La plate-forme Orion est constituée de 5 axes : microscopie photonique, cytométrie, histologie, microscopie à force atomique, analyses de données et d’images.
Mission
Activités principales
Définir en collaboration avec les utilisateurs de la plate-forme, une stratégie de traitement et d’analyse des données
Mettre en œuvre la stratégie retenue en utilisant les logiciels du domaine et en proposant en collaboration avec les équipes des solutions de traitement et d’analyse à façon
Développer les boites à outils logiciels nécessaires à la réalisation de l’analyse
Former en expert les utilisateurs et collaborateurs de la plate-forme aux technologies mises à disposition
Rédiger les notes techniques et les tutoriaux relatifs aux méthodes de traitement et d’analyse d’images et aux ressources logicielles disponibles
Conseiller les utilisateurs sur les possibilités techniques, leurs limites, les méthodes d’analyse, leur interprétation, et en assurer le suivi
Participer à la gestion des moyens techniques, humains et financiers alloués
Organiser et contrôler l’utilisation collective de l’appareillage et des postes de travail
Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d’activité
Assurer l’application des principes et des règles d’hygiène et de sécurité
Compétences
Utiliser en expert les logiciels dédiés au traitement et à l’analyse des images (Matlab ,Imaris, Fiji, Icy, Napari, Qpath)
Maîtriser les langages de programmation Python, MATLAB, Java, C/C++.
Expérience ou formation avancée en Machine Learning : Apprentissage supervisé, classification, CNN (convolutional neural network)
Maîtriser au moins un des frameworks de deep learning (OpenCV, Scikit, TensorFlow ou Pytorch)
Bonne connaissance des méthodes conventionnelles d’analyse d’images (algorithmes de segmentation, du suivi des objets, de la reconnaissance des formes.
Connaissance générale des bases de données images et de leur mise en place sur serveur OMERO
Maîtriser le développement de plugins sous Fiji/ImageJ, QuPath.
Maîtriser l’environnement Linux
Connaissances
Biologie : méthodologie appliquée (connaissance générale)
Environnement et réseaux professionnels (connaissance générale)
Réglementation en matière d’hygiène et de sécurité
Cadre légal et déontologique
Langue anglaise : C1
Compétences comportementales
Capacité de raisonnement analytique
Créativité / Sens de l’innovation
Profil
Poste réservé aux contractuels,
Catégorie A - Ingénieur de recherche
Modalités de candidature
Le Dossier De Candidature, Constitué Des Documents Suivants
Une lettre de motivation
Un curriculum vitae précisant l’employeur et la situation statutaire
Il doit être adressé dans un délai de 1 mois suivant la publication à la Direction des Ressources Humaines
Référence de l'offre : wac5bsqs5i
About the Company
Le Collège de France est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche unique au monde. Depuis sa création en 1530, il répond à une double vocation : être le lieu de la recherche la plus audacieuse et celui de son enseignement. On y enseigne à tous les publics intéressés, gratuitement et sans aucune condition d'inscription ni de diplôme, "le savoir en train de se constituer dans tous les domaines des lettres, des sciences ou des arts", et on y mène une recherche de pointe en partenariat avec de grandes ins...
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