AP-HP DIRECTION DE LA RECHERCHE CLINIQUE ET DE L'INNOVATION (DRCI)

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AP-HP DIRECTION DE LA RECHERCHE CLINIQUE ET DE L'INNOVATION (DRCI)
Ingénieur d'Étude en Bio-informatique-Génomique-Biologie Computationnelle F/H

Ingénieur d'Étude en Bio-informatique-Génomique-Biologie Computationnelle F/H

Hybrid

Colombes, France

€ 30,000 /year

Full Time

04-12-2025

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Skills

Python Bash Linux Machine Learning

Job Specifications

Missions principales

1. Développement de pipelines bio-informatiques
. Développer, optimiser et maintenir des workflows analytiques pour l'étude génomique de phages et de bactéries.
. Annotation, identification des récepteurs et des systèmes de défense, typage et analyse comparative.

2. Analyse de données et modélisation
. Réaliser des analyses statistiques inférentielles sur des jeux de données complexes.
. Développer des modèles d'apprentissage automatique (random forest, régression, XGBoost).
. Assurer la reproductibilité, la documentation et la traçabilité des analyses.

3. Intégration et gestion des données
. Structurer, documenter et contrôler la qualité des jeux de données.
. Participer aux rapports scientifiques et à la valorisation des résultats.

4. Interaction avec l'équipe expérimentale
. Intégration des données issues de plaques assays et courbes de croissance.
. Participation à la conception des méthodes expérimentales.

Profil recherché
Formation
. Master 2 ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique, génomique, biostatistiques, microbiologie computationnelle ou domaine associé.
Compétences techniques
. Excellente maîtrise de Python et/ou R.
. Bonne connaissance de Bash / Linux.
. Maîtrise des outils bioinformatiques courants (assemblage, annotation, analyse comparative).
. Bases solides en statistiques.
. Connaissances en machine learning appréciées.

Qualités personnelles
. Rigueur, autonomie, organisation.
. Curiosité scientifique et esprit critique.
. Capacité à travailler en équipe dans un environnement pluridisciplinaire.

About the Company

AP-HP (Greater Paris University Hospitals) is a European world-renowned university hospital. Its 39 hospitals treat 8 million people every year: in consultation, emergency, during scheduled or home hospitalizations. The AP-HP provides a public health service for everyone, 24 hours a day. This mission is a duty as well as a great source of pride. AP-HP is the leading employer in the Greater Paris area: 100.000 staff members - doctors, researchers, paramedical staff, administrative personnel and workers - work there. Know more